污水处理中，需要使用的各种制剂有良好的杀菌效果，而就消毒而言，次氯酸钠液还是具有明显优势的，次氯酸钠用作处理含氰废水和一些工业重度污染废水的高级氧化，还可以用于纸浆等漂白。高浓度的次氯酸钠液体还可以用于剥离设备及管道上附着的沾泥，次氯酸钠还能够分解蔬菜、水果等农副产品上所残存的微量的农药。

次氯酸钠溶液是国内外应用最广泛的含氯漂白剂、消毒剂、防腐剂和净水剂。但次氯酸钠溶液的稳定性较差，应低温贮存，避免光照。温度和紫外光对次氯酸钠的稳定性有很大影响。次氯酸钠溶液的分解速率随温度或光照（特别是紫外光）的升高而明显加快。一方面，随着温度和光照的增加，次氯酸钠分子的运动速度加快，活化能降低，活化分子含量增加，有效碰撞机会增加，反应速率常数增大。从而加速了次氯酸钠的分解；另一方面，它可能与次氯酸钠的分解机理有关。由此可见，次氯酸钠分解反应的关键步骤是释放原子氧，光或加热有利于原子氧的形成。当温度低于25℃时，分解速率较慢，当温度高于30℃时，分解速度明显加快。次氯酸钠的有效氯在光照20小时后降解90%。另外，次氯酸钠分解形成的O_2和Cl_2是气体物质，长期对包装容器造成危害。因此，次氯酸钠包装容器应留有通风口，以防发生安全事故。